Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPRAP18433 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPRAP18433 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPRAP18433 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPRAP18433 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPRAP18433 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPRAP18433 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPRAP18433 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRAP18433 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRAP18433 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPRAP18433 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTPRAP18433 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTPRAP18433 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PTPRAP18433 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPRAP18433 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPRAP18433 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPRAP18433 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPRAP18433 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPRAP18433 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPRAP18433 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRAP18433 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRAP18433 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
PTPRAP18433 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
PTPRAP18433 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
PTPRAP18433 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PTPRAP18433 RNU6ATAC14P-201ENST00000516218 91 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PTPRAP18433 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
PTPRAP18433 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PTPRAP18433 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PTPRAP18433 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PTPRAP18433 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
PTPRAP18433 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTPRAP18433 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRAP18433 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPRAP18433 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPRAP18433 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRAP18433 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PTPRAP18433 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PTPRAP18433 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PTPRAP18433 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTPRAP18433 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTPRAP18433 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTPRAP18433 RNU6-836P-201ENST00000362920 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PTPRAP18433 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PTPRAP18433 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PTPRAP18433 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PTPRAP18433 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PTPRAP18433 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PTPRAP18433 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PTPRAP18433 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PTPRAP18433 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PTPRAP18433 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTPRAP18433 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
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PTPRAP18433 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
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PTPRAP18433 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
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PTPRAP18433 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
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PTPRAP18433 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
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PTPRAP18433 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTPRAP18433 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
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PTPRAP18433 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRAP18433 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRAP18433 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPRAP18433 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPRAP18433 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPRAP18433 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPRAP18433 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPRAP18433 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
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PTPRAP18433 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPRAP18433 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
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PTPRAP18433 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPRAP18433 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPRAP18433 RNU6-133P-201ENST00000383989 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPRAP18433 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPRAP18433 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
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PTPRAP18433 MIR656-201ENST00000385224 78 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PTPRAP18433 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
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PTPRAP18433 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
PTPRAP18433 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PTPRAP18433 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PTPRAP18433 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PTPRAP18433 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PTPRAP18433 Y_RNA.406-201ENST00000383984 100 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PTPRAP18433 RNU6-1340P-201ENST00000384438 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PTPRAP18433 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PTPRAP18433 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
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PTPRAP18433 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
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