Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
HHLA3Q9XRX5 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
HHLA3Q9XRX5 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
HHLA3Q9XRX5 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
HHLA3Q9XRX5 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
HHLA3Q9XRX5 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
HHLA3Q9XRX5 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
HHLA3Q9XRX5 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
HHLA3Q9XRX5 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
HHLA3Q9XRX5 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
HHLA3Q9XRX5 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
HHLA3Q9XRX5 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
HHLA3Q9XRX5 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
HHLA3Q9XRX5 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
HHLA3Q9XRX5 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
HHLA3Q9XRX5 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
HHLA3Q9XRX5 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
HHLA3Q9XRX5 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
HHLA3Q9XRX5 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
HHLA3Q9XRX5 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
HHLA3Q9XRX5 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
HHLA3Q9XRX5 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
HHLA3Q9XRX5 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
HHLA3Q9XRX5 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
HHLA3Q9XRX5 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
HHLA3Q9XRX5 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
HHLA3Q9XRX5 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
HHLA3Q9XRX5 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
HHLA3Q9XRX5 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
HHLA3Q9XRX5 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
HHLA3Q9XRX5 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
HHLA3Q9XRX5 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
HHLA3Q9XRX5 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
HHLA3Q9XRX5 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
HHLA3Q9XRX5 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
HHLA3Q9XRX5 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
HHLA3Q9XRX5 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
HHLA3Q9XRX5 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
HHLA3Q9XRX5 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
HHLA3Q9XRX5 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
HHLA3Q9XRX5 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
HHLA3Q9XRX5 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
HHLA3Q9XRX5 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
HHLA3Q9XRX5 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
HHLA3Q9XRX5 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-2.5□□□□□ -2.81
HHLA3Q9XRX5 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
HHLA3Q9XRX5 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
HHLA3Q9XRX5 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
HHLA3Q9XRX5 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
HHLA3Q9XRX5 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
HHLA3Q9XRX5 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
HHLA3Q9XRX5 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
HHLA3Q9XRX5 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
HHLA3Q9XRX5 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
HHLA3Q9XRX5 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
HHLA3Q9XRX5 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
HHLA3Q9XRX5 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
HHLA3Q9XRX5 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
HHLA3Q9XRX5 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
HHLA3Q9XRX5 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
HHLA3Q9XRX5 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
HHLA3Q9XRX5 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
HHLA3Q9XRX5 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
HHLA3Q9XRX5 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
HHLA3Q9XRX5 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
HHLA3Q9XRX5 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
HHLA3Q9XRX5 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
HHLA3Q9XRX5 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
HHLA3Q9XRX5 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
HHLA3Q9XRX5 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
HHLA3Q9XRX5 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
HHLA3Q9XRX5 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
HHLA3Q9XRX5 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
HHLA3Q9XRX5 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
HHLA3Q9XRX5 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
HHLA3Q9XRX5 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
HHLA3Q9XRX5 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
HHLA3Q9XRX5 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
HHLA3Q9XRX5 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
HHLA3Q9XRX5 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
HHLA3Q9XRX5 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
HHLA3Q9XRX5 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
HHLA3Q9XRX5 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
HHLA3Q9XRX5 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
HHLA3Q9XRX5 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
HHLA3Q9XRX5 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
HHLA3Q9XRX5 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
HHLA3Q9XRX5 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
HHLA3Q9XRX5 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
HHLA3Q9XRX5 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
HHLA3Q9XRX5 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
HHLA3Q9XRX5 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
HHLA3Q9XRX5 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
HHLA3Q9XRX5 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
HHLA3Q9XRX5 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
HHLA3Q9XRX5 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
HHLA3Q9XRX5 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
HHLA3Q9XRX5 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
HHLA3Q9XRX5 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
HHLA3Q9XRX5 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 388.1 ms