Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
C9orf72Q96LT7 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
C9orf72Q96LT7 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
C9orf72Q96LT7 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
C9orf72Q96LT7 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
C9orf72Q96LT7 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
C9orf72Q96LT7 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
C9orf72Q96LT7 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
C9orf72Q96LT7 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
C9orf72Q96LT7 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
C9orf72Q96LT7 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
C9orf72Q96LT7 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
C9orf72Q96LT7 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
C9orf72Q96LT7 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
C9orf72Q96LT7 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
C9orf72Q96LT7 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
C9orf72Q96LT7 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
C9orf72Q96LT7 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
C9orf72Q96LT7 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
C9orf72Q96LT7 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
C9orf72Q96LT7 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
C9orf72Q96LT7 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
C9orf72Q96LT7 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
C9orf72Q96LT7 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
C9orf72Q96LT7 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
C9orf72Q96LT7 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
C9orf72Q96LT7 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
C9orf72Q96LT7 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
C9orf72Q96LT7 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
C9orf72Q96LT7 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
C9orf72Q96LT7 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
C9orf72Q96LT7 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
C9orf72Q96LT7 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
C9orf72Q96LT7 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
C9orf72Q96LT7 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
C9orf72Q96LT7 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
C9orf72Q96LT7 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
C9orf72Q96LT7 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
C9orf72Q96LT7 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
C9orf72Q96LT7 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
C9orf72Q96LT7 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
C9orf72Q96LT7 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
C9orf72Q96LT7 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
C9orf72Q96LT7 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
C9orf72Q96LT7 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
C9orf72Q96LT7 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
C9orf72Q96LT7 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
C9orf72Q96LT7 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
C9orf72Q96LT7 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
C9orf72Q96LT7 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
C9orf72Q96LT7 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
C9orf72Q96LT7 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
C9orf72Q96LT7 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
C9orf72Q96LT7 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
C9orf72Q96LT7 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
C9orf72Q96LT7 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
C9orf72Q96LT7 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
C9orf72Q96LT7 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
C9orf72Q96LT7 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
C9orf72Q96LT7 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
C9orf72Q96LT7 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
C9orf72Q96LT7 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
C9orf72Q96LT7 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
C9orf72Q96LT7 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
C9orf72Q96LT7 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
C9orf72Q96LT7 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
C9orf72Q96LT7 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
C9orf72Q96LT7 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
C9orf72Q96LT7 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
C9orf72Q96LT7 MIR5693-201ENST00000577722 73 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
C9orf72Q96LT7 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
C9orf72Q96LT7 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
C9orf72Q96LT7 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
C9orf72Q96LT7 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
C9orf72Q96LT7 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
C9orf72Q96LT7 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
C9orf72Q96LT7 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
C9orf72Q96LT7 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
C9orf72Q96LT7 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
C9orf72Q96LT7 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
C9orf72Q96LT7 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
C9orf72Q96LT7 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
C9orf72Q96LT7 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
C9orf72Q96LT7 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
C9orf72Q96LT7 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
C9orf72Q96LT7 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
C9orf72Q96LT7 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
C9orf72Q96LT7 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
C9orf72Q96LT7 RNY4P25-201ENST00000459254 96 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
C9orf72Q96LT7 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
C9orf72Q96LT7 AL731768.1-201ENST00000603124 139 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
C9orf72Q96LT7 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
C9orf72Q96LT7 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
C9orf72Q96LT7 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
C9orf72Q96LT7 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
C9orf72Q96LT7 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
C9orf72Q96LT7 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
C9orf72Q96LT7 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-3.24□□□□□ -2.93
C9orf72Q96LT7 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
C9orf72Q96LT7 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
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