Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
PKNOX2Q96KN3 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
PKNOX2Q96KN3 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
PKNOX2Q96KN3 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
PKNOX2Q96KN3 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
PKNOX2Q96KN3 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
PKNOX2Q96KN3 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
PKNOX2Q96KN3 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
PKNOX2Q96KN3 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
PKNOX2Q96KN3 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
PKNOX2Q96KN3 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
PKNOX2Q96KN3 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
PKNOX2Q96KN3 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
PKNOX2Q96KN3 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
PKNOX2Q96KN3 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
PKNOX2Q96KN3 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
PKNOX2Q96KN3 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
PKNOX2Q96KN3 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
PKNOX2Q96KN3 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
PKNOX2Q96KN3 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
PKNOX2Q96KN3 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
PKNOX2Q96KN3 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
PKNOX2Q96KN3 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
PKNOX2Q96KN3 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
PKNOX2Q96KN3 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
PKNOX2Q96KN3 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
PKNOX2Q96KN3 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
PKNOX2Q96KN3 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
PKNOX2Q96KN3 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
PKNOX2Q96KN3 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
PKNOX2Q96KN3 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
PKNOX2Q96KN3 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
PKNOX2Q96KN3 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
PKNOX2Q96KN3 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
PKNOX2Q96KN3 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
PKNOX2Q96KN3 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
PKNOX2Q96KN3 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
PKNOX2Q96KN3 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
PKNOX2Q96KN3 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
PKNOX2Q96KN3 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
PKNOX2Q96KN3 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
PKNOX2Q96KN3 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
PKNOX2Q96KN3 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
PKNOX2Q96KN3 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
PKNOX2Q96KN3 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
PKNOX2Q96KN3 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
PKNOX2Q96KN3 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
PKNOX2Q96KN3 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
PKNOX2Q96KN3 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-2.51□□□□□ -2.81
PKNOX2Q96KN3 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
PKNOX2Q96KN3 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
PKNOX2Q96KN3 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
PKNOX2Q96KN3 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
PKNOX2Q96KN3 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
PKNOX2Q96KN3 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
PKNOX2Q96KN3 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
PKNOX2Q96KN3 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
PKNOX2Q96KN3 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
PKNOX2Q96KN3 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
PKNOX2Q96KN3 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
PKNOX2Q96KN3 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
PKNOX2Q96KN3 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
PKNOX2Q96KN3 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
PKNOX2Q96KN3 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
PKNOX2Q96KN3 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
PKNOX2Q96KN3 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
PKNOX2Q96KN3 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
PKNOX2Q96KN3 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
PKNOX2Q96KN3 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
PKNOX2Q96KN3 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.61□□□□□ -2.83
PKNOX2Q96KN3 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
PKNOX2Q96KN3 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
PKNOX2Q96KN3 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
PKNOX2Q96KN3 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
PKNOX2Q96KN3 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
PKNOX2Q96KN3 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
PKNOX2Q96KN3 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
PKNOX2Q96KN3 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
PKNOX2Q96KN3 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-2.62□□□□□ -2.83
PKNOX2Q96KN3 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
PKNOX2Q96KN3 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
PKNOX2Q96KN3 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
PKNOX2Q96KN3 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
PKNOX2Q96KN3 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
PKNOX2Q96KN3 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
PKNOX2Q96KN3 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
PKNOX2Q96KN3 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
PKNOX2Q96KN3 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
PKNOX2Q96KN3 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
PKNOX2Q96KN3 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
PKNOX2Q96KN3 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
PKNOX2Q96KN3 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
PKNOX2Q96KN3 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
PKNOX2Q96KN3 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
PKNOX2Q96KN3 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
PKNOX2Q96KN3 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
PKNOX2Q96KN3 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
PKNOX2Q96KN3 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
PKNOX2Q96KN3 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
PKNOX2Q96KN3 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
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