Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCT1

ZNF260, Zinc finger protein 260, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF260Q3ZCT1 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ZNF260Q3ZCT1 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ZNF260Q3ZCT1 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ZNF260Q3ZCT1 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZNF260Q3ZCT1 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ZNF260Q3ZCT1 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ZNF260Q3ZCT1 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ZNF260Q3ZCT1 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ZNF260Q3ZCT1 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ZNF260Q3ZCT1 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ZNF260Q3ZCT1 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ZNF260Q3ZCT1 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ZNF260Q3ZCT1 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ZNF260Q3ZCT1 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ZNF260Q3ZCT1 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ZNF260Q3ZCT1 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ZNF260Q3ZCT1 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ZNF260Q3ZCT1 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ZNF260Q3ZCT1 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ZNF260Q3ZCT1 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ZNF260Q3ZCT1 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ZNF260Q3ZCT1 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ZNF260Q3ZCT1 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ZNF260Q3ZCT1 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ZNF260Q3ZCT1 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ZNF260Q3ZCT1 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ZNF260Q3ZCT1 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ZNF260Q3ZCT1 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ZNF260Q3ZCT1 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ZNF260Q3ZCT1 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ZNF260Q3ZCT1 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ZNF260Q3ZCT1 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ZNF260Q3ZCT1 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ZNF260Q3ZCT1 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ZNF260Q3ZCT1 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ZNF260Q3ZCT1 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ZNF260Q3ZCT1 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ZNF260Q3ZCT1 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ZNF260Q3ZCT1 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ZNF260Q3ZCT1 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ZNF260Q3ZCT1 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ZNF260Q3ZCT1 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ZNF260Q3ZCT1 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ZNF260Q3ZCT1 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ZNF260Q3ZCT1 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
ZNF260Q3ZCT1 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ZNF260Q3ZCT1 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ZNF260Q3ZCT1 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ZNF260Q3ZCT1 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ZNF260Q3ZCT1 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ZNF260Q3ZCT1 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ZNF260Q3ZCT1 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ZNF260Q3ZCT1 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ZNF260Q3ZCT1 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ZNF260Q3ZCT1 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ZNF260Q3ZCT1 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ZNF260Q3ZCT1 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ZNF260Q3ZCT1 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZNF260Q3ZCT1 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-59P-201ENST00000384787 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ZNF260Q3ZCT1 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ZNF260Q3ZCT1 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ZNF260Q3ZCT1 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ZNF260Q3ZCT1 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ZNF260Q3ZCT1 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ZNF260Q3ZCT1 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ZNF260Q3ZCT1 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ZNF260Q3ZCT1 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ZNF260Q3ZCT1 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ZNF260Q3ZCT1 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ZNF260Q3ZCT1 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ZNF260Q3ZCT1 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ZNF260Q3ZCT1 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ZNF260Q3ZCT1 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ZNF260Q3ZCT1 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ZNF260Q3ZCT1 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ZNF260Q3ZCT1 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.8 ms