Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
TRAM1Q15629 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
TRAM1Q15629 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
TRAM1Q15629 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
TRAM1Q15629 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
TRAM1Q15629 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
TRAM1Q15629 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
TRAM1Q15629 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
TRAM1Q15629 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
TRAM1Q15629 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
TRAM1Q15629 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
TRAM1Q15629 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
TRAM1Q15629 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
TRAM1Q15629 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
TRAM1Q15629 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
TRAM1Q15629 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
TRAM1Q15629 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
TRAM1Q15629 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
TRAM1Q15629 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
TRAM1Q15629 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
TRAM1Q15629 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
TRAM1Q15629 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
TRAM1Q15629 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
TRAM1Q15629 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
TRAM1Q15629 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
TRAM1Q15629 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
TRAM1Q15629 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
TRAM1Q15629 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
TRAM1Q15629 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
TRAM1Q15629 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
TRAM1Q15629 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
TRAM1Q15629 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
TRAM1Q15629 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
TRAM1Q15629 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
TRAM1Q15629 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
TRAM1Q15629 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
TRAM1Q15629 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
TRAM1Q15629 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
TRAM1Q15629 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
TRAM1Q15629 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
TRAM1Q15629 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
TRAM1Q15629 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
TRAM1Q15629 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
TRAM1Q15629 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
TRAM1Q15629 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
TRAM1Q15629 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
TRAM1Q15629 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
TRAM1Q15629 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-3.39□□□□□ -2.95
TRAM1Q15629 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
TRAM1Q15629 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
TRAM1Q15629 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
TRAM1Q15629 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
TRAM1Q15629 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
TRAM1Q15629 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
TRAM1Q15629 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
TRAM1Q15629 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
TRAM1Q15629 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
TRAM1Q15629 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
TRAM1Q15629 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
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TRAM1Q15629 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
TRAM1Q15629 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
TRAM1Q15629 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
TRAM1Q15629 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
TRAM1Q15629 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
TRAM1Q15629 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
TRAM1Q15629 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
TRAM1Q15629 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
TRAM1Q15629 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-3.44□□□□□ -2.96
TRAM1Q15629 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
TRAM1Q15629 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
TRAM1Q15629 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
TRAM1Q15629 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
TRAM1Q15629 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
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TRAM1Q15629 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
TRAM1Q15629 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
TRAM1Q15629 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
TRAM1Q15629 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
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TRAM1Q15629 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
TRAM1Q15629 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
TRAM1Q15629 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
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TRAM1Q15629 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
TRAM1Q15629 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
TRAM1Q15629 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
TRAM1Q15629 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
TRAM1Q15629 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
TRAM1Q15629 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
TRAM1Q15629 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
TRAM1Q15629 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
TRAM1Q15629 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
TRAM1Q15629 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
TRAM1Q15629 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
TRAM1Q15629 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
TRAM1Q15629 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
TRAM1Q15629 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
TRAM1Q15629 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
TRAM1Q15629 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
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