Protein–RNA interactions for Protein: Q13136

PPFIA1, Liprin-alpha-1, humanhuman

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Length 1,202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA1Q13136 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PPFIA1Q13136 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PPFIA1Q13136 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PPFIA1Q13136 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PPFIA1Q13136 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PPFIA1Q13136 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PPFIA1Q13136 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PPFIA1Q13136 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PPFIA1Q13136 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PPFIA1Q13136 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PPFIA1Q13136 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PPFIA1Q13136 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PPFIA1Q13136 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PPFIA1Q13136 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-1.69□□□□□ -2.68
PPFIA1Q13136 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PPFIA1Q13136 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
PPFIA1Q13136 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
PPFIA1Q13136 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
PPFIA1Q13136 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
PPFIA1Q13136 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
PPFIA1Q13136 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
PPFIA1Q13136 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
PPFIA1Q13136 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
PPFIA1Q13136 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
PPFIA1Q13136 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
PPFIA1Q13136 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
PPFIA1Q13136 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
PPFIA1Q13136 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
PPFIA1Q13136 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
PPFIA1Q13136 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
PPFIA1Q13136 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
PPFIA1Q13136 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
PPFIA1Q13136 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
PPFIA1Q13136 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
PPFIA1Q13136 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
PPFIA1Q13136 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
PPFIA1Q13136 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-1.75□□□□□ -2.69
PPFIA1Q13136 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
PPFIA1Q13136 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
PPFIA1Q13136 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PPFIA1Q13136 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PPFIA1Q13136 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PPFIA1Q13136 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PPFIA1Q13136 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
PPFIA1Q13136 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
PPFIA1Q13136 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
PPFIA1Q13136 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
PPFIA1Q13136 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
PPFIA1Q13136 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
PPFIA1Q13136 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
PPFIA1Q13136 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
PPFIA1Q13136 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PPFIA1Q13136 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PPFIA1Q13136 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PPFIA1Q13136 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PPFIA1Q13136 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PPFIA1Q13136 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PPFIA1Q13136 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-1.84□□□□□ -2.7
PPFIA1Q13136 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
PPFIA1Q13136 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
PPFIA1Q13136 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PPFIA1Q13136 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
PPFIA1Q13136 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
PPFIA1Q13136 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
PPFIA1Q13136 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PPFIA1Q13136 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PPFIA1Q13136 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-1.88□□□□□ -2.71
PPFIA1Q13136 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PPFIA1Q13136 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PPFIA1Q13136 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PPFIA1Q13136 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PPFIA1Q13136 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PPFIA1Q13136 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PPFIA1Q13136 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PPFIA1Q13136 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PPFIA1Q13136 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PPFIA1Q13136 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
PPFIA1Q13136 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
PPFIA1Q13136 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1.92□□□□□ -2.72
PPFIA1Q13136 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
PPFIA1Q13136 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
PPFIA1Q13136 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
PPFIA1Q13136 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
PPFIA1Q13136 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
PPFIA1Q13136 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PPFIA1Q13136 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PPFIA1Q13136 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PPFIA1Q13136 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PPFIA1Q13136 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
PPFIA1Q13136 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
PPFIA1Q13136 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
PPFIA1Q13136 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
PPFIA1Q13136 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
PPFIA1Q13136 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
PPFIA1Q13136 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
PPFIA1Q13136 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
PPFIA1Q13136 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PPFIA1Q13136 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PPFIA1Q13136 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
PPFIA1Q13136 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
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