Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
HCN3Q9P1Z3 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HCN3Q9P1Z3 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HCN3Q9P1Z3 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HCN3Q9P1Z3 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HCN3Q9P1Z3 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HCN3Q9P1Z3 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HCN3Q9P1Z3 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HCN3Q9P1Z3 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HCN3Q9P1Z3 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HCN3Q9P1Z3 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
HCN3Q9P1Z3 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HCN3Q9P1Z3 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HCN3Q9P1Z3 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HCN3Q9P1Z3 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HCN3Q9P1Z3 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HCN3Q9P1Z3 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HCN3Q9P1Z3 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HCN3Q9P1Z3 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HCN3Q9P1Z3 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HCN3Q9P1Z3 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HCN3Q9P1Z3 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HCN3Q9P1Z3 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HCN3Q9P1Z3 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HCN3Q9P1Z3 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HCN3Q9P1Z3 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
HCN3Q9P1Z3 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
HCN3Q9P1Z3 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
HCN3Q9P1Z3 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
HCN3Q9P1Z3 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
HCN3Q9P1Z3 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
HCN3Q9P1Z3 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
HCN3Q9P1Z3 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
HCN3Q9P1Z3 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
HCN3Q9P1Z3 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
HCN3Q9P1Z3 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
HCN3Q9P1Z3 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
HCN3Q9P1Z3 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
HCN3Q9P1Z3 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
HCN3Q9P1Z3 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
HCN3Q9P1Z3 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HCN3Q9P1Z3 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HCN3Q9P1Z3 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HCN3Q9P1Z3 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HCN3Q9P1Z3 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HCN3Q9P1Z3 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HCN3Q9P1Z3 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HCN3Q9P1Z3 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HCN3Q9P1Z3 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HCN3Q9P1Z3 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HCN3Q9P1Z3 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HCN3Q9P1Z3 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HCN3Q9P1Z3 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HCN3Q9P1Z3 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HCN3Q9P1Z3 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HCN3Q9P1Z3 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HCN3Q9P1Z3 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HCN3Q9P1Z3 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
HCN3Q9P1Z3 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HCN3Q9P1Z3 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HCN3Q9P1Z3 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HCN3Q9P1Z3 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HCN3Q9P1Z3 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HCN3Q9P1Z3 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HCN3Q9P1Z3 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HCN3Q9P1Z3 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HCN3Q9P1Z3 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HCN3Q9P1Z3 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HCN3Q9P1Z3 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
HCN3Q9P1Z3 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
HCN3Q9P1Z3 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
HCN3Q9P1Z3 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
HCN3Q9P1Z3 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
HCN3Q9P1Z3 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
HCN3Q9P1Z3 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
HCN3Q9P1Z3 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
HCN3Q9P1Z3 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
HCN3Q9P1Z3 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
HCN3Q9P1Z3 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
HCN3Q9P1Z3 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
HCN3Q9P1Z3 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
HCN3Q9P1Z3 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
HCN3Q9P1Z3 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
HCN3Q9P1Z3 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-0.93□□□□□ -2.56
HCN3Q9P1Z3 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
HCN3Q9P1Z3 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
HCN3Q9P1Z3 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
HCN3Q9P1Z3 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
HCN3Q9P1Z3 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
HCN3Q9P1Z3 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
HCN3Q9P1Z3 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.6 ms