Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ZBED3Q96IU2 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ZBED3Q96IU2 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ZBED3Q96IU2 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ZBED3Q96IU2 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ZBED3Q96IU2 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ZBED3Q96IU2 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ZBED3Q96IU2 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ZBED3Q96IU2 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ZBED3Q96IU2 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ZBED3Q96IU2 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ZBED3Q96IU2 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ZBED3Q96IU2 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ZBED3Q96IU2 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ZBED3Q96IU2 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ZBED3Q96IU2 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ZBED3Q96IU2 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ZBED3Q96IU2 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ZBED3Q96IU2 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ZBED3Q96IU2 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ZBED3Q96IU2 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ZBED3Q96IU2 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ZBED3Q96IU2 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ZBED3Q96IU2 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ZBED3Q96IU2 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ZBED3Q96IU2 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ZBED3Q96IU2 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ZBED3Q96IU2 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ZBED3Q96IU2 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ZBED3Q96IU2 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ZBED3Q96IU2 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ZBED3Q96IU2 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
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