Protein–RNA interactions for Protein: Q70JA7

CHSY3, Chondroitin sulfate synthase 3, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY3Q70JA7 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHSY3Q70JA7 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHSY3Q70JA7 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHSY3Q70JA7 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHSY3Q70JA7 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHSY3Q70JA7 RNU6ATAC14P-201ENST00000516218 91 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHSY3Q70JA7 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CHSY3Q70JA7 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CHSY3Q70JA7 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CHSY3Q70JA7 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CHSY3Q70JA7 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CHSY3Q70JA7 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CHSY3Q70JA7 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CHSY3Q70JA7 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CHSY3Q70JA7 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CHSY3Q70JA7 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CHSY3Q70JA7 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CHSY3Q70JA7 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CHSY3Q70JA7 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CHSY3Q70JA7 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CHSY3Q70JA7 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CHSY3Q70JA7 U6.103-201ENST00000637085 61 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CHSY3Q70JA7 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CHSY3Q70JA7 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CHSY3Q70JA7 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CHSY3Q70JA7 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CHSY3Q70JA7 RNU6-59P-201ENST00000384787 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CHSY3Q70JA7 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CHSY3Q70JA7 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CHSY3Q70JA7 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
CHSY3Q70JA7 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CHSY3Q70JA7 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CHSY3Q70JA7 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CHSY3Q70JA7 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CHSY3Q70JA7 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
CHSY3Q70JA7 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CHSY3Q70JA7 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CHSY3Q70JA7 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHSY3Q70JA7 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHSY3Q70JA7 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHSY3Q70JA7 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHSY3Q70JA7 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHSY3Q70JA7 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CHSY3Q70JA7 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CHSY3Q70JA7 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CHSY3Q70JA7 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
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CHSY3Q70JA7 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
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CHSY3Q70JA7 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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CHSY3Q70JA7 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CHSY3Q70JA7 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
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CHSY3Q70JA7 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
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CHSY3Q70JA7 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CHSY3Q70JA7 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CHSY3Q70JA7 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CHSY3Q70JA7 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
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CHSY3Q70JA7 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CHSY3Q70JA7 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CHSY3Q70JA7 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CHSY3Q70JA7 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CHSY3Q70JA7 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CHSY3Q70JA7 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CHSY3Q70JA7 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CHSY3Q70JA7 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.24□□□□□ -2.37
CHSY3Q70JA7 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CHSY3Q70JA7 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CHSY3Q70JA7 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CHSY3Q70JA7 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
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