Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
USP43Q70EL4 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
USP43Q70EL4 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
USP43Q70EL4 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
USP43Q70EL4 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
USP43Q70EL4 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
USP43Q70EL4 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
USP43Q70EL4 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
USP43Q70EL4 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
USP43Q70EL4 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
USP43Q70EL4 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
USP43Q70EL4 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
USP43Q70EL4 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
USP43Q70EL4 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
USP43Q70EL4 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
USP43Q70EL4 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
USP43Q70EL4 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
USP43Q70EL4 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
USP43Q70EL4 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
USP43Q70EL4 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
USP43Q70EL4 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
USP43Q70EL4 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
USP43Q70EL4 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.23□□□□□ -2.37
USP43Q70EL4 RNU6-59P-201ENST00000384787 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
USP43Q70EL4 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
USP43Q70EL4 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
USP43Q70EL4 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
USP43Q70EL4 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
USP43Q70EL4 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
USP43Q70EL4 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
USP43Q70EL4 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
USP43Q70EL4 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
USP43Q70EL4 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
USP43Q70EL4 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
USP43Q70EL4 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
USP43Q70EL4 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
USP43Q70EL4 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
USP43Q70EL4 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
USP43Q70EL4 RNU6-724P-201ENST00000390958 105 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
USP43Q70EL4 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
USP43Q70EL4 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
USP43Q70EL4 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
USP43Q70EL4 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
USP43Q70EL4 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
USP43Q70EL4 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
USP43Q70EL4 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
USP43Q70EL4 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
USP43Q70EL4 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
USP43Q70EL4 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
USP43Q70EL4 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
USP43Q70EL4 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
USP43Q70EL4 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
USP43Q70EL4 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
USP43Q70EL4 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
USP43Q70EL4 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
USP43Q70EL4 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
USP43Q70EL4 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
USP43Q70EL4 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
USP43Q70EL4 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
USP43Q70EL4 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
USP43Q70EL4 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
USP43Q70EL4 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
USP43Q70EL4 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
USP43Q70EL4 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
USP43Q70EL4 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
USP43Q70EL4 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
USP43Q70EL4 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
USP43Q70EL4 RNU6ATAC14P-201ENST00000516218 91 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
USP43Q70EL4 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
USP43Q70EL4 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
USP43Q70EL4 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
USP43Q70EL4 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
USP43Q70EL4 U6.103-201ENST00000637085 61 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
USP43Q70EL4 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
USP43Q70EL4 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
USP43Q70EL4 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
USP43Q70EL4 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
USP43Q70EL4 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
USP43Q70EL4 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
USP43Q70EL4 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
USP43Q70EL4 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
USP43Q70EL4 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
USP43Q70EL4 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
USP43Q70EL4 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
USP43Q70EL4 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
USP43Q70EL4 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
USP43Q70EL4 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
USP43Q70EL4 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
USP43Q70EL4 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
USP43Q70EL4 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.11□□□□□ -2.39
USP43Q70EL4 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
USP43Q70EL4 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
USP43Q70EL4 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
USP43Q70EL4 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
USP43Q70EL4 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
USP43Q70EL4 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
USP43Q70EL4 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
USP43Q70EL4 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
USP43Q70EL4 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
USP43Q70EL4 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
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