Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
BRD3Q15059 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
BRD3Q15059 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
BRD3Q15059 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
BRD3Q15059 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
BRD3Q15059 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
BRD3Q15059 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
BRD3Q15059 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
BRD3Q15059 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
BRD3Q15059 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.39□□□□□ -2.63
BRD3Q15059 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
BRD3Q15059 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
BRD3Q15059 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
BRD3Q15059 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
BRD3Q15059 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
BRD3Q15059 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
BRD3Q15059 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
BRD3Q15059 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
BRD3Q15059 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
BRD3Q15059 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
BRD3Q15059 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
BRD3Q15059 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
BRD3Q15059 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
BRD3Q15059 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
BRD3Q15059 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
BRD3Q15059 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
BRD3Q15059 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
BRD3Q15059 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
BRD3Q15059 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
BRD3Q15059 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
BRD3Q15059 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
BRD3Q15059 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
BRD3Q15059 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
BRD3Q15059 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
BRD3Q15059 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
BRD3Q15059 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
BRD3Q15059 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
BRD3Q15059 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
BRD3Q15059 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
BRD3Q15059 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
BRD3Q15059 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
BRD3Q15059 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
BRD3Q15059 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
BRD3Q15059 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
BRD3Q15059 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
BRD3Q15059 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
BRD3Q15059 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
BRD3Q15059 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
BRD3Q15059 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
BRD3Q15059 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
BRD3Q15059 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
BRD3Q15059 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
BRD3Q15059 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
BRD3Q15059 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
BRD3Q15059 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
BRD3Q15059 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
BRD3Q15059 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
BRD3Q15059 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
BRD3Q15059 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
BRD3Q15059 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
BRD3Q15059 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
BRD3Q15059 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
BRD3Q15059 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
BRD3Q15059 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
BRD3Q15059 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
BRD3Q15059 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
BRD3Q15059 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
BRD3Q15059 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
BRD3Q15059 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
BRD3Q15059 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
BRD3Q15059 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
BRD3Q15059 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
BRD3Q15059 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
BRD3Q15059 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
BRD3Q15059 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
BRD3Q15059 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
BRD3Q15059 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
BRD3Q15059 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
BRD3Q15059 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
BRD3Q15059 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
BRD3Q15059 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
BRD3Q15059 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
BRD3Q15059 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
BRD3Q15059 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
BRD3Q15059 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
BRD3Q15059 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
BRD3Q15059 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-1.61□□□□□ -2.67
BRD3Q15059 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
BRD3Q15059 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
BRD3Q15059 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
BRD3Q15059 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
BRD3Q15059 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
BRD3Q15059 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
BRD3Q15059 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
BRD3Q15059 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
BRD3Q15059 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
BRD3Q15059 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
BRD3Q15059 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
BRD3Q15059 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
BRD3Q15059 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 547.6 ms