Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
COL9A3Q14050 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
COL9A3Q14050 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
COL9A3Q14050 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
COL9A3Q14050 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
COL9A3Q14050 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
COL9A3Q14050 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
COL9A3Q14050 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
COL9A3Q14050 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
COL9A3Q14050 RNU6-620P-201ENST00000384017 96 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
COL9A3Q14050 RNU6-1024P-201ENST00000384199 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
COL9A3Q14050 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
COL9A3Q14050 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
COL9A3Q14050 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
COL9A3Q14050 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
COL9A3Q14050 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
COL9A3Q14050 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
COL9A3Q14050 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
COL9A3Q14050 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
COL9A3Q14050 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
COL9A3Q14050 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
COL9A3Q14050 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
COL9A3Q14050 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
COL9A3Q14050 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
COL9A3Q14050 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
COL9A3Q14050 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
COL9A3Q14050 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
COL9A3Q14050 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
COL9A3Q14050 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
COL9A3Q14050 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
COL9A3Q14050 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
COL9A3Q14050 Y_RNA.335-201ENST00000365299 96 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
COL9A3Q14050 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
COL9A3Q14050 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
COL9A3Q14050 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
COL9A3Q14050 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
COL9A3Q14050 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
COL9A3Q14050 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
COL9A3Q14050 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
COL9A3Q14050 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
COL9A3Q14050 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
COL9A3Q14050 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
COL9A3Q14050 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
COL9A3Q14050 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
COL9A3Q14050 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
COL9A3Q14050 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
COL9A3Q14050 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
COL9A3Q14050 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
COL9A3Q14050 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
COL9A3Q14050 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
COL9A3Q14050 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
COL9A3Q14050 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
COL9A3Q14050 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
COL9A3Q14050 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
COL9A3Q14050 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
COL9A3Q14050 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
COL9A3Q14050 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
COL9A3Q14050 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
COL9A3Q14050 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
COL9A3Q14050 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
COL9A3Q14050 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
COL9A3Q14050 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
COL9A3Q14050 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
COL9A3Q14050 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
COL9A3Q14050 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
COL9A3Q14050 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
COL9A3Q14050 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
COL9A3Q14050 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
COL9A3Q14050 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
COL9A3Q14050 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
COL9A3Q14050 MIR656-201ENST00000385224 78 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
COL9A3Q14050 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
COL9A3Q14050 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
COL9A3Q14050 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
COL9A3Q14050 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
COL9A3Q14050 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
COL9A3Q14050 RNU6-892P-201ENST00000410335 99 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
COL9A3Q14050 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
COL9A3Q14050 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
COL9A3Q14050 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
COL9A3Q14050 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
COL9A3Q14050 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
COL9A3Q14050 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
COL9A3Q14050 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
COL9A3Q14050 RNU6-854P-201ENST00000364036 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
COL9A3Q14050 RNU6-1043P-201ENST00000410355 99 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
COL9A3Q14050 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
COL9A3Q14050 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
COL9A3Q14050 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
COL9A3Q14050 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
COL9A3Q14050 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
COL9A3Q14050 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
COL9A3Q14050 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
COL9A3Q14050 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
COL9A3Q14050 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
COL9A3Q14050 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
COL9A3Q14050 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
COL9A3Q14050 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
COL9A3Q14050 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
COL9A3Q14050 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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