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Protein–RNA interactions for Protein: Q13618
CUL3, Cullin-3, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
CUL3
Q13618
MIR548V-201
ENST00000584165
80 nt
BASIC
-1.35
□□□□□ -2.63
CUL3
Q13618
U6.58-201
ENST00000613107
107 nt
BASIC
-1.35
□□□□□ -2.63
CUL3
Q13618
Y_RNA.81-201
ENST00000362997
102 nt
BASIC
-1.36
□□□□□ -2.63
CUL3
Q13618
Y_RNA.325-201
ENST00000365171
122 nt
BASIC
-1.36
□□□□□ -2.63
CUL3
Q13618
MIR527-201
ENST00000385244
85 nt
BASIC
-1.36
□□□□□ -2.63
CUL3
Q13618
RNA5SP266-201
ENST00000410273
108 nt
BASIC
-1.36
□□□□□ -2.63
CUL3
Q13618
RNU6ATAC17P-201
ENST00000516074
71 nt
BASIC
-1.36
□□□□□ -2.63
CUL3
Q13618
RNU6-587P-201
ENST00000391282
106 nt
BASIC
-1.37
□□□□□ -2.63
CUL3
Q13618
RNU6-1174P-201
ENST00000517278
101 nt
BASIC
-1.37
□□□□□ -2.63
CUL3
Q13618
MIR5591-201
ENST00000578248
65 nt
BASIC
-1.37
□□□□□ -2.63
CUL3
Q13618
U4.4-201
ENST00000620626
117 nt
BASIC
-1.37
□□□□□ -2.63
CUL3
Q13618
MIR429-201
ENST00000362106
83 nt
BASIC
-1.38
□□□□□ -2.63
CUL3
Q13618
RNU6-1276P-201
ENST00000365372
104 nt
BASIC
-1.38
□□□□□ -2.63
CUL3
Q13618
AC138207.3-201
ENST00000585289
166 nt
BASIC
-1.38
□□□□□ -2.63
CUL3
Q13618
Y_RNA.181-201
ENST00000363872
101 nt
BASIC
-1.39
□□□□□ -2.63
CUL3
Q13618
Y_RNA.282-201
ENST00000364793
102 nt
BASIC
-1.39
□□□□□ -2.63
CUL3
Q13618
RNA5SP180-201
ENST00000516181
101 nt
BASIC
-1.39
□□□□□ -2.63
CUL3
Q13618
MIR5582-201
ENST00000579697
68 nt
BASIC
-1.39
□□□□□ -2.63
CUL3
Q13618
RNA5SP215-201
ENST00000363440
122 nt
BASIC
-1.4
□□□□□ -2.63
CUL3
Q13618
MIR1246-201
ENST00000636535
73 nt
BASIC
-1.4
□□□□□ -2.63
CUL3
Q13618
RNU6-1241P-201
ENST00000384536
107 nt
BASIC
-1.41
□□□□□ -2.64
CUL3
Q13618
RNU6-70P-201
ENST00000516438
60 nt
BASIC
-1.41
□□□□□ -2.64
CUL3
Q13618
Y_RNA.369-201
ENST00000365568
117 nt
BASIC
-1.42
□□□□□ -2.64
CUL3
Q13618
MIR630-201
ENST00000384957
97 nt
BASIC
-1.42
□□□□□ -2.64
CUL3
Q13618
MIR507-201
ENST00000385234
94 nt
BASIC
-1.42
□□□□□ -2.64
CUL3
Q13618
SNORD19-201
ENST00000391191
68 nt
BASIC
-1.42
□□□□□ -2.64
CUL3
Q13618
MIR889-201
ENST00000401280
79 nt
BASIC
-1.42
□□□□□ -2.64
CUL3
Q13618
MIR1285-2-201
ENST00000408311
88 nt
BASIC
-1.42
□□□□□ -2.64
CUL3
Q13618
Y_RNA.94-201
ENST00000363068
106 nt
BASIC
-1.43
□□□□□ -2.64
CUL3
Q13618
Y_RNA.109-201
ENST00000363215
102 nt
BASIC
-1.43
□□□□□ -2.64
CUL3
Q13618
Y_RNA.442-201
ENST00000384131
102 nt
BASIC
-1.43
□□□□□ -2.64
CUL3
Q13618
MIR4666B-201
ENST00000578142
81 nt
BASIC
-1.43
□□□□□ -2.64
CUL3
Q13618
MIR5683-201
ENST00000636514
76 nt
BASIC
-1.43
□□□□□ -2.64
CUL3
Q13618
MIR29B1-201
ENST00000385015
81 nt
BASIC
-1.44
□□□□□ -2.64
CUL3
Q13618
MIR154-201
ENST00000385243
84 nt
BASIC
-1.44
□□□□□ -2.64
CUL3
Q13618
RNU6-696P-201
ENST00000390834
107 nt
BASIC
-1.44
□□□□□ -2.64
CUL3
Q13618
MIR548Q-201
ENST00000408404
100 nt
BASIC
-1.44
□□□□□ -2.64
CUL3
Q13618
AP002795.1-201
ENST00000534879
84 nt
BASIC
-1.44
□□□□□ -2.64
CUL3
Q13618
MIR4520-1-201
ENST00000582609
70 nt
BASIC
-1.44
□□□□□ -2.64
CUL3
Q13618
MIR4490-201
ENST00000582647
84 nt
BASIC
-1.44
□□□□□ -2.64
CUL3
Q13618
SNORD113-2-201
ENST00000391082
72 nt
BASIC
-1.45
□□□□□ -2.64
CUL3
Q13618
MIR6818-201
ENST00000621576
65 nt
BASIC
-1.45
□□□□□ -2.64
CUL3
Q13618
Y_RNA.457-201
ENST00000384237
111 nt
BASIC
-1.46
□□□□□ -2.64
CUL3
Q13618
RNA5SP173-201
ENST00000364857
136 nt
BASIC
-1.47
□□□□□ -2.64
CUL3
Q13618
RNU6-895P-201
ENST00000384125
103 nt
BASIC
-1.47
□□□□□ -2.64
CUL3
Q13618
RNU6-820P-201
ENST00000384273
107 nt
BASIC
-1.47
□□□□□ -2.64
CUL3
Q13618
SNX3P1X-201
ENST00000414887
175 nt
BASIC
-1.47
□□□□□ -2.64
CUL3
Q13618
Y_RNA.788-201
ENST00000622394
112 nt
BASIC
-1.47
□□□□□ -2.64
CUL3
Q13618
RNU6-1262P-201
ENST00000516217
96 nt
BASIC
-1.48
□□□□□ -2.65
CUL3
Q13618
MIR4770-201
ENST00000579149
58 nt
BASIC
-1.48
□□□□□ -2.65
CUL3
Q13618
RNA5SP331-201
ENST00000364986
107 nt
BASIC
-1.49
□□□□□ -2.65
CUL3
Q13618
RNU6-540P-201
ENST00000384622
101 nt
BASIC
-1.49
□□□□□ -2.65
CUL3
Q13618
AL078612.1-201
ENST00000533009
150 nt
TSL 5
BASIC
-1.49
□□□□□ -2.65
CUL3
Q13618
AC062037.1-201
ENST00000605302
128 nt
BASIC
-1.49
□□□□□ -2.65
CUL3
Q13618
MIR601-201
ENST00000385256
79 nt
BASIC
-1.5
□□□□□ -2.65
CUL3
Q13618
RNA5SP26-201
ENST00000362406
119 nt
BASIC
-1.51
□□□□□ -2.65
CUL3
Q13618
RNU6-598P-201
ENST00000364017
105 nt
BASIC
-1.51
□□□□□ -2.65
CUL3
Q13618
RNU6-787P-201
ENST00000384032
107 nt
BASIC
-1.51
□□□□□ -2.65
CUL3
Q13618
MIR3134-201
ENST00000579433
74 nt
BASIC
-1.51
□□□□□ -2.65
CUL3
Q13618
MIR365A-201
ENST00000362260
87 nt
BASIC
-1.52
□□□□□ -2.65
CUL3
Q13618
Y_RNA.232-201
ENST00000364369
96 nt
BASIC
-1.52
□□□□□ -2.65
CUL3
Q13618
RNU6-576P-201
ENST00000390854
102 nt
BASIC
-1.52
□□□□□ -2.65
CUL3
Q13618
MIR4441-201
ENST00000582623
100 nt
BASIC
-1.52
□□□□□ -2.65
CUL3
Q13618
SNORD115-31-201
ENST00000365318
82 nt
BASIC
-1.53
□□□□□ -2.65
CUL3
Q13618
SNORD116-16-201
ENST00000384533
92 nt
BASIC
-1.53
□□□□□ -2.65
CUL3
Q13618
SNORD116-24-201
ENST00000384549
92 nt
BASIC
-1.53
□□□□□ -2.65
CUL3
Q13618
Y_RNA.375-201
ENST00000365625
101 nt
BASIC
-1.54
□□□□□ -2.66
CUL3
Q13618
MIR6502-201
ENST00000617296
76 nt
BASIC
-1.54
□□□□□ -2.66
CUL3
Q13618
ULK3-223
ENST00000631115
126 nt
TSL 5
BASIC
-1.54
□□□□□ -2.66
CUL3
Q13618
RPL35AP4-201
ENST00000412007
102 nt
BASIC
-1.55
□□□□□ -2.66
CUL3
Q13618
U2.18-201
ENST00000622185
84 nt
BASIC
-1.55
□□□□□ -2.66
CUL3
Q13618
RNA5SP170-201
ENST00000517150
101 nt
BASIC
-1.56
□□□□□ -2.66
CUL3
Q13618
AL627230.5-201
ENST00000619807
58 nt
BASIC
-1.56
□□□□□ -2.66
CUL3
Q13618
RNU6-1152P-201
ENST00000384576
107 nt
BASIC
-1.57
□□□□□ -2.66
CUL3
Q13618
Y_RNA.543-201
ENST00000384649
107 nt
BASIC
-1.57
□□□□□ -2.66
CUL3
Q13618
RNU6-687P-201
ENST00000516443
89 nt
BASIC
-1.57
□□□□□ -2.66
CUL3
Q13618
SNORA41B-201
ENST00000384785
128 nt
BASIC
-1.58
□□□□□ -2.66
CUL3
Q13618
RNU6-411P-201
ENST00000384451
107 nt
BASIC
-1.59
□□□□□ -2.66
CUL3
Q13618
RNU6-630P-201
ENST00000391258
106 nt
BASIC
-1.59
□□□□□ -2.66
CUL3
Q13618
RNU6-983P-201
ENST00000516004
103 nt
BASIC
-1.59
□□□□□ -2.66
CUL3
Q13618
MIR198-201
ENST00000637333
62 nt
BASIC
-1.59
□□□□□ -2.66
CUL3
Q13618
RNU6-1298P-201
ENST00000362456
101 nt
BASIC
-1.6
□□□□□ -2.67
CUL3
Q13618
RNA5SP86-201
ENST00000390869
98 nt
BASIC
-1.6
□□□□□ -2.67
CUL3
Q13618
AC091912.2-201
ENST00000624798
167 nt
BASIC
-1.6
□□□□□ -2.67
CUL3
Q13618
MIR6874-201
ENST00000635894
71 nt
BASIC
-1.6
□□□□□ -2.67
CUL3
Q13618
U7.4-201
ENST00000614961
63 nt
BASIC
-1.61
□□□□□ -2.67
CUL3
Q13618
SNORD18.1-201
ENST00000363807
70 nt
BASIC
-1.62
□□□□□ -2.67
CUL3
Q13618
RNU6-164P-201
ENST00000364604
103 nt
BASIC
-1.62
□□□□□ -2.67
CUL3
Q13618
Y_RNA.616-201
ENST00000410835
95 nt
BASIC
-1.62
□□□□□ -2.67
CUL3
Q13618
AC090616.4-201
ENST00000448026
115 nt
BASIC
-1.62
□□□□□ -2.67
CUL3
Q13618
Y_RNA.55-201
ENST00000362797
102 nt
BASIC
-1.64
□□□□□ -2.67
CUL3
Q13618
SNORD1B-201
ENST00000363091
84 nt
BASIC
-1.64
□□□□□ -2.67
CUL3
Q13618
SNORD73B-201
ENST00000364394
72 nt
BASIC
-1.64
□□□□□ -2.67
CUL3
Q13618
MIR548AA1-201
ENST00000384971
97 nt
BASIC
-1.64
□□□□□ -2.67
CUL3
Q13618
RNU6-1015P-201
ENST00000517121
99 nt
BASIC
-1.64
□□□□□ -2.67
CUL3
Q13618
MIR3202-2-201
ENST00000635980
79 nt
BASIC
-1.64
□□□□□ -2.67
CUL3
Q13618
MIR548H1-201
ENST00000408610
102 nt
BASIC
-1.65
□□□□□ -2.67
CUL3
Q13618
RNU6-542P-201
ENST00000516405
103 nt
BASIC
-1.65
□□□□□ -2.67
CUL3
Q13618
MIR520D-201
ENST00000385002
87 nt
BASIC
-1.66
□□□□□ -2.68
CUL3
Q13618
MIR1468-201
ENST00000410600
86 nt
BASIC
-1.66
□□□□□ -2.68
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