Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SF3B2Q13435 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SF3B2Q13435 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SF3B2Q13435 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SF3B2Q13435 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SF3B2Q13435 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SF3B2Q13435 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SF3B2Q13435 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SF3B2Q13435 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SF3B2Q13435 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SF3B2Q13435 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SF3B2Q13435 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SF3B2Q13435 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SF3B2Q13435 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SF3B2Q13435 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SF3B2Q13435 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SF3B2Q13435 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SF3B2Q13435 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
SF3B2Q13435 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SF3B2Q13435 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SF3B2Q13435 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SF3B2Q13435 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SF3B2Q13435 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SF3B2Q13435 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SF3B2Q13435 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SF3B2Q13435 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SF3B2Q13435 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SF3B2Q13435 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SF3B2Q13435 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SF3B2Q13435 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SF3B2Q13435 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SF3B2Q13435 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SF3B2Q13435 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SF3B2Q13435 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SF3B2Q13435 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SF3B2Q13435 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SF3B2Q13435 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SF3B2Q13435 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SF3B2Q13435 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SF3B2Q13435 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SF3B2Q13435 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SF3B2Q13435 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SF3B2Q13435 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SF3B2Q13435 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SF3B2Q13435 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SF3B2Q13435 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SF3B2Q13435 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SF3B2Q13435 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SF3B2Q13435 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SF3B2Q13435 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SF3B2Q13435 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SF3B2Q13435 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SF3B2Q13435 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SF3B2Q13435 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SF3B2Q13435 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SF3B2Q13435 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SF3B2Q13435 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SF3B2Q13435 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SF3B2Q13435 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SF3B2Q13435 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SF3B2Q13435 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SF3B2Q13435 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SF3B2Q13435 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SF3B2Q13435 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SF3B2Q13435 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SF3B2Q13435 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SF3B2Q13435 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SF3B2Q13435 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SF3B2Q13435 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SF3B2Q13435 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SF3B2Q13435 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SF3B2Q13435 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SF3B2Q13435 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SF3B2Q13435 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SF3B2Q13435 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SF3B2Q13435 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SF3B2Q13435 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SF3B2Q13435 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SF3B2Q13435 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SF3B2Q13435 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SF3B2Q13435 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SF3B2Q13435 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SF3B2Q13435 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SF3B2Q13435 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SF3B2Q13435 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SF3B2Q13435 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SF3B2Q13435 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SF3B2Q13435 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SF3B2Q13435 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SF3B2Q13435 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SF3B2Q13435 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SF3B2Q13435 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SF3B2Q13435 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SF3B2Q13435 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SF3B2Q13435 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SF3B2Q13435 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SF3B2Q13435 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SF3B2Q13435 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SF3B2Q13435 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SF3B2Q13435 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 214.3 ms