Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SP140Q13342 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SP140Q13342 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SP140Q13342 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SP140Q13342 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SP140Q13342 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SP140Q13342 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SP140Q13342 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SP140Q13342 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SP140Q13342 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SP140Q13342 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
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SP140Q13342 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
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SP140Q13342 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
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SP140Q13342 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SP140Q13342 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SP140Q13342 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
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SP140Q13342 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SP140Q13342 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SP140Q13342 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SP140Q13342 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SP140Q13342 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SP140Q13342 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SP140Q13342 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SP140Q13342 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SP140Q13342 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
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SP140Q13342 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SP140Q13342 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SP140Q13342 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SP140Q13342 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SP140Q13342 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SP140Q13342 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
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SP140Q13342 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
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SP140Q13342 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
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SP140Q13342 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
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SP140Q13342 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SP140Q13342 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
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SP140Q13342 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
SP140Q13342 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SP140Q13342 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SP140Q13342 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SP140Q13342 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SP140Q13342 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
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