Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SP140Q13342 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SP140Q13342 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SP140Q13342 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SP140Q13342 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SP140Q13342 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SP140Q13342 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SP140Q13342 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SP140Q13342 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SP140Q13342 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SP140Q13342 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SP140Q13342 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SP140Q13342 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SP140Q13342 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SP140Q13342 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SP140Q13342 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SP140Q13342 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SP140Q13342 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SP140Q13342 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SP140Q13342 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SP140Q13342 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SP140Q13342 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SP140Q13342 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SP140Q13342 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SP140Q13342 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SP140Q13342 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SP140Q13342 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SP140Q13342 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SP140Q13342 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SP140Q13342 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
SP140Q13342 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SP140Q13342 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SP140Q13342 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SP140Q13342 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SP140Q13342 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SP140Q13342 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SP140Q13342 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SP140Q13342 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SP140Q13342 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SP140Q13342 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SP140Q13342 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SP140Q13342 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SP140Q13342 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SP140Q13342 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SP140Q13342 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SP140Q13342 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SP140Q13342 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SP140Q13342 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SP140Q13342 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SP140Q13342 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SP140Q13342 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SP140Q13342 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SP140Q13342 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SP140Q13342 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SP140Q13342 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SP140Q13342 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SP140Q13342 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SP140Q13342 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SP140Q13342 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SP140Q13342 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SP140Q13342 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SP140Q13342 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SP140Q13342 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SP140Q13342 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SP140Q13342 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SP140Q13342 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SP140Q13342 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SP140Q13342 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SP140Q13342 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SP140Q13342 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SP140Q13342 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SP140Q13342 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SP140Q13342 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SP140Q13342 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SP140Q13342 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SP140Q13342 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SP140Q13342 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SP140Q13342 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SP140Q13342 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SP140Q13342 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SP140Q13342 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SP140Q13342 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SP140Q13342 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SP140Q13342 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SP140Q13342 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SP140Q13342 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SP140Q13342 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SP140Q13342 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SP140Q13342 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SP140Q13342 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SP140Q13342 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SP140Q13342 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SP140Q13342 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SP140Q13342 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SP140Q13342 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
SP140Q13342 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SP140Q13342 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SP140Q13342 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SP140Q13342 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SP140Q13342 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170 ms