Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
TRAF1Q13077 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
TRAF1Q13077 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
TRAF1Q13077 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
TRAF1Q13077 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
TRAF1Q13077 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TRAF1Q13077 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TRAF1Q13077 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
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TRAF1Q13077 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
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TRAF1Q13077 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
TRAF1Q13077 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
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TRAF1Q13077 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TRAF1Q13077 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TRAF1Q13077 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TRAF1Q13077 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TRAF1Q13077 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
TRAF1Q13077 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
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TRAF1Q13077 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TRAF1Q13077 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRAF1Q13077 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRAF1Q13077 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRAF1Q13077 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRAF1Q13077 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRAF1Q13077 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRAF1Q13077 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRAF1Q13077 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
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