Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
CNTN1Q12860 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
CNTN1Q12860 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
CNTN1Q12860 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
CNTN1Q12860 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
CNTN1Q12860 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CNTN1Q12860 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CNTN1Q12860 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CNTN1Q12860 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CNTN1Q12860 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CNTN1Q12860 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CNTN1Q12860 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CNTN1Q12860 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CNTN1Q12860 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CNTN1Q12860 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CNTN1Q12860 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CNTN1Q12860 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CNTN1Q12860 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CNTN1Q12860 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.22□□□□□ -2.6
CNTN1Q12860 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CNTN1Q12860 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CNTN1Q12860 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CNTN1Q12860 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CNTN1Q12860 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CNTN1Q12860 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CNTN1Q12860 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CNTN1Q12860 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CNTN1Q12860 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CNTN1Q12860 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CNTN1Q12860 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CNTN1Q12860 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CNTN1Q12860 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CNTN1Q12860 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CNTN1Q12860 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CNTN1Q12860 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CNTN1Q12860 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CNTN1Q12860 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CNTN1Q12860 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CNTN1Q12860 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CNTN1Q12860 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CNTN1Q12860 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CNTN1Q12860 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CNTN1Q12860 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CNTN1Q12860 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CNTN1Q12860 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CNTN1Q12860 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CNTN1Q12860 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CNTN1Q12860 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CNTN1Q12860 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CNTN1Q12860 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CNTN1Q12860 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CNTN1Q12860 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CNTN1Q12860 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CNTN1Q12860 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CNTN1Q12860 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CNTN1Q12860 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CNTN1Q12860 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CNTN1Q12860 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CNTN1Q12860 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CNTN1Q12860 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CNTN1Q12860 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CNTN1Q12860 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CNTN1Q12860 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CNTN1Q12860 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CNTN1Q12860 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CNTN1Q12860 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CNTN1Q12860 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CNTN1Q12860 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CNTN1Q12860 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CNTN1Q12860 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CNTN1Q12860 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CNTN1Q12860 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CNTN1Q12860 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CNTN1Q12860 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CNTN1Q12860 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CNTN1Q12860 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CNTN1Q12860 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CNTN1Q12860 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CNTN1Q12860 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CNTN1Q12860 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CNTN1Q12860 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CNTN1Q12860 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CNTN1Q12860 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CNTN1Q12860 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CNTN1Q12860 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CNTN1Q12860 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CNTN1Q12860 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CNTN1Q12860 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CNTN1Q12860 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CNTN1Q12860 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CNTN1Q12860 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CNTN1Q12860 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CNTN1Q12860 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CNTN1Q12860 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CNTN1Q12860 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CNTN1Q12860 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CNTN1Q12860 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CNTN1Q12860 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CNTN1Q12860 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CNTN1Q12860 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.9 ms