Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
HTATSF1O43719 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
HTATSF1O43719 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
HTATSF1O43719 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
HTATSF1O43719 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
HTATSF1O43719 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
HTATSF1O43719 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
HTATSF1O43719 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
HTATSF1O43719 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
HTATSF1O43719 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
HTATSF1O43719 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
HTATSF1O43719 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
HTATSF1O43719 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
HTATSF1O43719 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
HTATSF1O43719 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
HTATSF1O43719 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
HTATSF1O43719 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
HTATSF1O43719 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
HTATSF1O43719 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
HTATSF1O43719 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
HTATSF1O43719 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
HTATSF1O43719 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
HTATSF1O43719 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
HTATSF1O43719 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
HTATSF1O43719 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
HTATSF1O43719 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
HTATSF1O43719 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
HTATSF1O43719 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
HTATSF1O43719 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
HTATSF1O43719 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
HTATSF1O43719 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
HTATSF1O43719 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
HTATSF1O43719 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
HTATSF1O43719 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
HTATSF1O43719 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
HTATSF1O43719 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.26□□□□□ -2.61
HTATSF1O43719 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
HTATSF1O43719 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
HTATSF1O43719 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
HTATSF1O43719 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-1.27□□□□□ -2.61
HTATSF1O43719 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
HTATSF1O43719 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
HTATSF1O43719 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
HTATSF1O43719 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
HTATSF1O43719 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
HTATSF1O43719 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
HTATSF1O43719 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
HTATSF1O43719 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
HTATSF1O43719 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
HTATSF1O43719 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
HTATSF1O43719 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
HTATSF1O43719 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
HTATSF1O43719 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
HTATSF1O43719 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
HTATSF1O43719 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
HTATSF1O43719 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
HTATSF1O43719 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
HTATSF1O43719 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
HTATSF1O43719 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
HTATSF1O43719 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
HTATSF1O43719 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
HTATSF1O43719 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
HTATSF1O43719 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
HTATSF1O43719 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
HTATSF1O43719 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
HTATSF1O43719 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
HTATSF1O43719 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
HTATSF1O43719 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
HTATSF1O43719 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
HTATSF1O43719 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
HTATSF1O43719 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
HTATSF1O43719 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
HTATSF1O43719 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
HTATSF1O43719 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
HTATSF1O43719 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
HTATSF1O43719 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-1.41□□□□□ -2.64
HTATSF1O43719 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
HTATSF1O43719 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
HTATSF1O43719 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
HTATSF1O43719 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
HTATSF1O43719 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
HTATSF1O43719 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
HTATSF1O43719 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
HTATSF1O43719 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
HTATSF1O43719 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
HTATSF1O43719 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
HTATSF1O43719 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
HTATSF1O43719 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
HTATSF1O43719 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
HTATSF1O43719 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
HTATSF1O43719 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
HTATSF1O43719 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
HTATSF1O43719 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
HTATSF1O43719 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
HTATSF1O43719 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
HTATSF1O43719 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
HTATSF1O43719 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
HTATSF1O43719 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
HTATSF1O43719 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
HTATSF1O43719 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
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