Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
SCN8AQ9UQD0 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
SCN8AQ9UQD0 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
SCN8AQ9UQD0 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
SCN8AQ9UQD0 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
SCN8AQ9UQD0 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
SCN8AQ9UQD0 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
SCN8AQ9UQD0 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
SCN8AQ9UQD0 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
SCN8AQ9UQD0 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
SCN8AQ9UQD0 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
SCN8AQ9UQD0 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-2.69□□□□□ -2.84
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
SCN8AQ9UQD0 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
SCN8AQ9UQD0 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
SCN8AQ9UQD0 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
SCN8AQ9UQD0 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
SCN8AQ9UQD0 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
SCN8AQ9UQD0 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.7□□□□□ -2.84
SCN8AQ9UQD0 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
SCN8AQ9UQD0 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
SCN8AQ9UQD0 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.85
SCN8AQ9UQD0 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.85
SCN8AQ9UQD0 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.85
SCN8AQ9UQD0 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.85
SCN8AQ9UQD0 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.85
SCN8AQ9UQD0 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.85
SCN8AQ9UQD0 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
SCN8AQ9UQD0 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
SCN8AQ9UQD0 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
SCN8AQ9UQD0 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
SCN8AQ9UQD0 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
SCN8AQ9UQD0 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
SCN8AQ9UQD0 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
SCN8AQ9UQD0 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
SCN8AQ9UQD0 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
SCN8AQ9UQD0 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
SCN8AQ9UQD0 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
SCN8AQ9UQD0 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
SCN8AQ9UQD0 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
SCN8AQ9UQD0 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
SCN8AQ9UQD0 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
SCN8AQ9UQD0 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
SCN8AQ9UQD0 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
SCN8AQ9UQD0 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
SCN8AQ9UQD0 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
SCN8AQ9UQD0 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
SCN8AQ9UQD0 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
SCN8AQ9UQD0 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
SCN8AQ9UQD0 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
SCN8AQ9UQD0 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.830-201ENST00000628531 96 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
SCN8AQ9UQD0 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
SCN8AQ9UQD0 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
SCN8AQ9UQD0 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
SCN8AQ9UQD0 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
SCN8AQ9UQD0 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
SCN8AQ9UQD0 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
SCN8AQ9UQD0 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
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