Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
FOXD1Q16676 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
FOXD1Q16676 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
FOXD1Q16676 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXD1Q16676 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXD1Q16676 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXD1Q16676 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXD1Q16676 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXD1Q16676 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXD1Q16676 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXD1Q16676 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXD1Q16676 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXD1Q16676 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXD1Q16676 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
FOXD1Q16676 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXD1Q16676 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXD1Q16676 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXD1Q16676 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXD1Q16676 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXD1Q16676 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXD1Q16676 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXD1Q16676 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXD1Q16676 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXD1Q16676 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXD1Q16676 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXD1Q16676 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXD1Q16676 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXD1Q16676 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXD1Q16676 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXD1Q16676 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXD1Q16676 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXD1Q16676 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXD1Q16676 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXD1Q16676 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXD1Q16676 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXD1Q16676 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXD1Q16676 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXD1Q16676 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXD1Q16676 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXD1Q16676 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXD1Q16676 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXD1Q16676 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXD1Q16676 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXD1Q16676 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXD1Q16676 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXD1Q16676 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXD1Q16676 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXD1Q16676 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
FOXD1Q16676 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXD1Q16676 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXD1Q16676 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXD1Q16676 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXD1Q16676 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXD1Q16676 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXD1Q16676 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXD1Q16676 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXD1Q16676 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXD1Q16676 MIR656-201ENST00000385224 78 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXD1Q16676 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXD1Q16676 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXD1Q16676 RNU6-1024P-201ENST00000384199 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXD1Q16676 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXD1Q16676 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXD1Q16676 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXD1Q16676 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXD1Q16676 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXD1Q16676 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXD1Q16676 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXD1Q16676 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXD1Q16676 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXD1Q16676 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXD1Q16676 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXD1Q16676 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXD1Q16676 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXD1Q16676 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXD1Q16676 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXD1Q16676 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXD1Q16676 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXD1Q16676 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXD1Q16676 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXD1Q16676 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXD1Q16676 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXD1Q16676 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXD1Q16676 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXD1Q16676 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXD1Q16676 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXD1Q16676 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXD1Q16676 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXD1Q16676 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXD1Q16676 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXD1Q16676 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXD1Q16676 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXD1Q16676 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXD1Q16676 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXD1Q16676 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXD1Q16676 RNU6-1340P-201ENST00000384438 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXD1Q16676 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXD1Q16676 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXD1Q16676 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXD1Q16676 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
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