Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HIF1AQ16665 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
HIF1AQ16665 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HIF1AQ16665 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HIF1AQ16665 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HIF1AQ16665 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HIF1AQ16665 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HIF1AQ16665 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HIF1AQ16665 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HIF1AQ16665 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HIF1AQ16665 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HIF1AQ16665 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HIF1AQ16665 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HIF1AQ16665 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HIF1AQ16665 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HIF1AQ16665 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HIF1AQ16665 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HIF1AQ16665 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HIF1AQ16665 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HIF1AQ16665 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
HIF1AQ16665 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
HIF1AQ16665 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
HIF1AQ16665 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HIF1AQ16665 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HIF1AQ16665 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HIF1AQ16665 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HIF1AQ16665 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HIF1AQ16665 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HIF1AQ16665 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HIF1AQ16665 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HIF1AQ16665 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HIF1AQ16665 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HIF1AQ16665 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HIF1AQ16665 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HIF1AQ16665 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HIF1AQ16665 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HIF1AQ16665 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HIF1AQ16665 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
HIF1AQ16665 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
HIF1AQ16665 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
HIF1AQ16665 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
HIF1AQ16665 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
HIF1AQ16665 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
HIF1AQ16665 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HIF1AQ16665 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HIF1AQ16665 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HIF1AQ16665 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HIF1AQ16665 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HIF1AQ16665 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HIF1AQ16665 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HIF1AQ16665 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HIF1AQ16665 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HIF1AQ16665 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HIF1AQ16665 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HIF1AQ16665 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HIF1AQ16665 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HIF1AQ16665 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HIF1AQ16665 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HIF1AQ16665 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HIF1AQ16665 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
HIF1AQ16665 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
HIF1AQ16665 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
HIF1AQ16665 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
HIF1AQ16665 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
HIF1AQ16665 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
HIF1AQ16665 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
HIF1AQ16665 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HIF1AQ16665 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HIF1AQ16665 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HIF1AQ16665 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HIF1AQ16665 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HIF1AQ16665 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HIF1AQ16665 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HIF1AQ16665 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.26□□□□□ -2.37
HIF1AQ16665 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HIF1AQ16665 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HIF1AQ16665 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
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HIF1AQ16665 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
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HIF1AQ16665 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
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HIF1AQ16665 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HIF1AQ16665 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HIF1AQ16665 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HIF1AQ16665 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HIF1AQ16665 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
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HIF1AQ16665 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HIF1AQ16665 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HIF1AQ16665 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HIF1AQ16665 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HIF1AQ16665 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HIF1AQ16665 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HIF1AQ16665 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HIF1AQ16665 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HIF1AQ16665 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HIF1AQ16665 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HIF1AQ16665 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
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