Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SNX17Q15036 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SNX17Q15036 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SNX17Q15036 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SNX17Q15036 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SNX17Q15036 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SNX17Q15036 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
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SNX17Q15036 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNX17Q15036 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
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SNX17Q15036 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SNX17Q15036 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
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SNX17Q15036 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SNX17Q15036 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SNX17Q15036 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SNX17Q15036 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SNX17Q15036 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SNX17Q15036 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SNX17Q15036 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SNX17Q15036 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.41□□□□□ -2.34
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SNX17Q15036 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
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SNX17Q15036 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
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SNX17Q15036 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SNX17Q15036 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
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SNX17Q15036 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
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SNX17Q15036 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
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SNX17Q15036 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
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SNX17Q15036 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SNX17Q15036 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SNX17Q15036 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SNX17Q15036 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
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