Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MKRN4PQ13434 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MKRN4PQ13434 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MKRN4PQ13434 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MKRN4PQ13434 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MKRN4PQ13434 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
MKRN4PQ13434 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
MKRN4PQ13434 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
MKRN4PQ13434 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
MKRN4PQ13434 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
MKRN4PQ13434 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
MKRN4PQ13434 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
MKRN4PQ13434 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
MKRN4PQ13434 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
MKRN4PQ13434 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
MKRN4PQ13434 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MKRN4PQ13434 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MKRN4PQ13434 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MKRN4PQ13434 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
MKRN4PQ13434 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
MKRN4PQ13434 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
MKRN4PQ13434 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
MKRN4PQ13434 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
MKRN4PQ13434 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
MKRN4PQ13434 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MKRN4PQ13434 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MKRN4PQ13434 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MKRN4PQ13434 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MKRN4PQ13434 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MKRN4PQ13434 RNU6-59P-201ENST00000384787 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MKRN4PQ13434 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MKRN4PQ13434 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MKRN4PQ13434 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MKRN4PQ13434 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MKRN4PQ13434 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
MKRN4PQ13434 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MKRN4PQ13434 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MKRN4PQ13434 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MKRN4PQ13434 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MKRN4PQ13434 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MKRN4PQ13434 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MKRN4PQ13434 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MKRN4PQ13434 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MKRN4PQ13434 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MKRN4PQ13434 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MKRN4PQ13434 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MKRN4PQ13434 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MKRN4PQ13434 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MKRN4PQ13434 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MKRN4PQ13434 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MKRN4PQ13434 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MKRN4PQ13434 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MKRN4PQ13434 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MKRN4PQ13434 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MKRN4PQ13434 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
MKRN4PQ13434 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
MKRN4PQ13434 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
MKRN4PQ13434 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
MKRN4PQ13434 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
MKRN4PQ13434 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MKRN4PQ13434 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MKRN4PQ13434 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
MKRN4PQ13434 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MKRN4PQ13434 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MKRN4PQ13434 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MKRN4PQ13434 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MKRN4PQ13434 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MKRN4PQ13434 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MKRN4PQ13434 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MKRN4PQ13434 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MKRN4PQ13434 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
MKRN4PQ13434 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
MKRN4PQ13434 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
MKRN4PQ13434 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
MKRN4PQ13434 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MKRN4PQ13434 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MKRN4PQ13434 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MKRN4PQ13434 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
MKRN4PQ13434 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
MKRN4PQ13434 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
MKRN4PQ13434 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MKRN4PQ13434 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MKRN4PQ13434 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MKRN4PQ13434 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MKRN4PQ13434 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MKRN4PQ13434 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MKRN4PQ13434 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
MKRN4PQ13434 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MKRN4PQ13434 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MKRN4PQ13434 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MKRN4PQ13434 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MKRN4PQ13434 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MKRN4PQ13434 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MKRN4PQ13434 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MKRN4PQ13434 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MKRN4PQ13434 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MKRN4PQ13434 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MKRN4PQ13434 RNU6-894P-201ENST00000517094 105 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MKRN4PQ13434 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
MKRN4PQ13434 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
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