Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SP140Q13342 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SP140Q13342 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SP140Q13342 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SP140Q13342 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SP140Q13342 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
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SP140Q13342 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SP140Q13342 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SP140Q13342 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
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SP140Q13342 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
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SP140Q13342 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SP140Q13342 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SP140Q13342 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
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SP140Q13342 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SP140Q13342 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
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SP140Q13342 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
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SP140Q13342 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SP140Q13342 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SP140Q13342 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SP140Q13342 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SP140Q13342 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
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SP140Q13342 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
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SP140Q13342 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SP140Q13342 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
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SP140Q13342 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
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SP140Q13342 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SP140Q13342 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SP140Q13342 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SP140Q13342 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SP140Q13342 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SP140Q13342 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SP140Q13342 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
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