Protein–RNA interactions for Protein: O00470

MEIS1, Homeobox protein Meis1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1O00470 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
MEIS1O00470 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
MEIS1O00470 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
MEIS1O00470 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
MEIS1O00470 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
MEIS1O00470 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
MEIS1O00470 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
MEIS1O00470 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
MEIS1O00470 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
MEIS1O00470 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
MEIS1O00470 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
MEIS1O00470 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
MEIS1O00470 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
MEIS1O00470 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
MEIS1O00470 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
MEIS1O00470 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
MEIS1O00470 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
MEIS1O00470 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
MEIS1O00470 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
MEIS1O00470 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
MEIS1O00470 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
MEIS1O00470 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
MEIS1O00470 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
MEIS1O00470 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
MEIS1O00470 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
MEIS1O00470 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
MEIS1O00470 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
MEIS1O00470 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
MEIS1O00470 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
MEIS1O00470 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
MEIS1O00470 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
MEIS1O00470 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
MEIS1O00470 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
MEIS1O00470 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
MEIS1O00470 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
MEIS1O00470 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
MEIS1O00470 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
MEIS1O00470 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
MEIS1O00470 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
MEIS1O00470 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
MEIS1O00470 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
MEIS1O00470 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
MEIS1O00470 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
MEIS1O00470 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
MEIS1O00470 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
MEIS1O00470 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
MEIS1O00470 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
MEIS1O00470 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
MEIS1O00470 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
MEIS1O00470 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
MEIS1O00470 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
MEIS1O00470 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
MEIS1O00470 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
MEIS1O00470 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
MEIS1O00470 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
MEIS1O00470 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
MEIS1O00470 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
MEIS1O00470 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
MEIS1O00470 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
MEIS1O00470 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
MEIS1O00470 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
MEIS1O00470 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
MEIS1O00470 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
MEIS1O00470 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
MEIS1O00470 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
MEIS1O00470 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
MEIS1O00470 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
MEIS1O00470 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
MEIS1O00470 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
MEIS1O00470 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
MEIS1O00470 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
MEIS1O00470 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC0□□□□□ -2.41
MEIS1O00470 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC0□□□□□ -2.41
MEIS1O00470 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC0□□□□□ -2.41
MEIS1O00470 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC0□□□□□ -2.41
MEIS1O00470 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
MEIS1O00470 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
MEIS1O00470 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
MEIS1O00470 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
MEIS1O00470 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
MEIS1O00470 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
MEIS1O00470 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
MEIS1O00470 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
MEIS1O00470 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
MEIS1O00470 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
MEIS1O00470 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
MEIS1O00470 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
MEIS1O00470 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.04□□□□□ -2.42
MEIS1O00470 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
MEIS1O00470 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
MEIS1O00470 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
MEIS1O00470 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
MEIS1O00470 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
MEIS1O00470 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
MEIS1O00470 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
MEIS1O00470 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
MEIS1O00470 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
MEIS1O00470 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
MEIS1O00470 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
MEIS1O00470 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.1 ms