Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.335-201ENST00000365299 96 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-422P-201ENST00000384632 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 SOX2OT_exon4.1-201ENST00000610449 109 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
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KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR363-201ENST00000384840 75 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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KRTAP9-3Q9BYQ3 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-737P-201ENST00000365370 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNY4P13-201ENST00000384284 96 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1340P-201ENST00000384438 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
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