Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SIX1Q15475 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SIX1Q15475 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SIX1Q15475 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SIX1Q15475 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SIX1Q15475 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SIX1Q15475 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SIX1Q15475 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SIX1Q15475 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SIX1Q15475 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SIX1Q15475 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SIX1Q15475 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SIX1Q15475 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SIX1Q15475 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SIX1Q15475 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SIX1Q15475 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SIX1Q15475 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SIX1Q15475 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SIX1Q15475 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SIX1Q15475 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SIX1Q15475 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SIX1Q15475 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SIX1Q15475 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SIX1Q15475 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SIX1Q15475 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SIX1Q15475 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SIX1Q15475 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SIX1Q15475 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SIX1Q15475 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SIX1Q15475 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SIX1Q15475 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SIX1Q15475 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SIX1Q15475 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SIX1Q15475 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SIX1Q15475 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SIX1Q15475 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SIX1Q15475 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SIX1Q15475 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SIX1Q15475 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SIX1Q15475 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SIX1Q15475 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SIX1Q15475 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SIX1Q15475 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SIX1Q15475 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SIX1Q15475 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SIX1Q15475 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SIX1Q15475 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SIX1Q15475 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SIX1Q15475 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SIX1Q15475 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SIX1Q15475 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SIX1Q15475 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SIX1Q15475 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SIX1Q15475 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SIX1Q15475 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SIX1Q15475 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SIX1Q15475 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SIX1Q15475 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SIX1Q15475 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SIX1Q15475 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SIX1Q15475 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SIX1Q15475 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SIX1Q15475 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SIX1Q15475 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SIX1Q15475 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
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SIX1Q15475 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
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SIX1Q15475 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
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SIX1Q15475 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
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SIX1Q15475 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SIX1Q15475 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SIX1Q15475 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SIX1Q15475 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SIX1Q15475 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SIX1Q15475 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SIX1Q15475 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SIX1Q15475 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SIX1Q15475 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SIX1Q15475 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SIX1Q15475 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
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