Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 AL731768.1-201ENST00000603124 139 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC-3.85□□□□□ -3.03
SHPRHQ149N8 SNORD114-13-201ENST00000364377 74 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
SHPRHQ149N8 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
SHPRHQ149N8 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
SHPRHQ149N8 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
SHPRHQ149N8 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
SHPRHQ149N8 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-3.87□□□□□ -3.03
SHPRHQ149N8 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-3.87□□□□□ -3.03
SHPRHQ149N8 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-3.87□□□□□ -3.03
SHPRHQ149N8 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC-3.87□□□□□ -3.03
SHPRHQ149N8 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
SHPRHQ149N8 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
SHPRHQ149N8 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
SHPRHQ149N8 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
SHPRHQ149N8 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
SHPRHQ149N8 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
SHPRHQ149N8 Y_RNA.652-201ENST00000458902 102 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
SHPRHQ149N8 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
SHPRHQ149N8 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
SHPRHQ149N8 Y_RNA.520-201ENST00000384556 102 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
SHPRHQ149N8 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
SHPRHQ149N8 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
SHPRHQ149N8 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
SHPRHQ149N8 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
SHPRHQ149N8 Y_RNA.612-201ENST00000410717 95 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
SHPRHQ149N8 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
SHPRHQ149N8 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
SHPRHQ149N8 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.04
SHPRHQ149N8 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.04
SHPRHQ149N8 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
SHPRHQ149N8 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
SHPRHQ149N8 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
SHPRHQ149N8 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
SHPRHQ149N8 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
SHPRHQ149N8 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
SHPRHQ149N8 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
SHPRHQ149N8 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
SHPRHQ149N8 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
SHPRHQ149N8 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
SHPRHQ149N8 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
SHPRHQ149N8 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
SHPRHQ149N8 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
SHPRHQ149N8 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.04
SHPRHQ149N8 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.04
SHPRHQ149N8 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.04
SHPRHQ149N8 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.04
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SHPRHQ149N8 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.05
SHPRHQ149N8 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.05
SHPRHQ149N8 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.05
SHPRHQ149N8 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
SHPRHQ149N8 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
SHPRHQ149N8 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
SHPRHQ149N8 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
SHPRHQ149N8 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
SHPRHQ149N8 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
SHPRHQ149N8 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
SHPRHQ149N8 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
SHPRHQ149N8 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
SHPRHQ149N8 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
SHPRHQ149N8 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
SHPRHQ149N8 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.06
SHPRHQ149N8 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC-4.03□□□□□ -3.06
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SHPRHQ149N8 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
SHPRHQ149N8 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
SHPRHQ149N8 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
SHPRHQ149N8 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
SHPRHQ149N8 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
SHPRHQ149N8 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
SHPRHQ149N8 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
SHPRHQ149N8 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
SHPRHQ149N8 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
SHPRHQ149N8 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
SHPRHQ149N8 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
SHPRHQ149N8 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
SHPRHQ149N8 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
SHPRHQ149N8 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
SHPRHQ149N8 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
SHPRHQ149N8 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
SHPRHQ149N8 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
SHPRHQ149N8 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
SHPRHQ149N8 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
SHPRHQ149N8 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
SHPRHQ149N8 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
SHPRHQ149N8 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
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