Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NCOA4Q13772 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NCOA4Q13772 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NCOA4Q13772 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
NCOA4Q13772 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NCOA4Q13772 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NCOA4Q13772 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NCOA4Q13772 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NCOA4Q13772 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.61□□□□□ -2.31
NCOA4Q13772 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NCOA4Q13772 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NCOA4Q13772 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NCOA4Q13772 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NCOA4Q13772 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NCOA4Q13772 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NCOA4Q13772 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NCOA4Q13772 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NCOA4Q13772 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NCOA4Q13772 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NCOA4Q13772 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NCOA4Q13772 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NCOA4Q13772 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NCOA4Q13772 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NCOA4Q13772 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NCOA4Q13772 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NCOA4Q13772 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NCOA4Q13772 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NCOA4Q13772 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NCOA4Q13772 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NCOA4Q13772 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NCOA4Q13772 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NCOA4Q13772 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NCOA4Q13772 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NCOA4Q13772 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NCOA4Q13772 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NCOA4Q13772 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NCOA4Q13772 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NCOA4Q13772 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NCOA4Q13772 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NCOA4Q13772 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NCOA4Q13772 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NCOA4Q13772 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NCOA4Q13772 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.32
NCOA4Q13772 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NCOA4Q13772 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
NCOA4Q13772 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NCOA4Q13772 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NCOA4Q13772 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NCOA4Q13772 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NCOA4Q13772 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NCOA4Q13772 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NCOA4Q13772 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NCOA4Q13772 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NCOA4Q13772 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NCOA4Q13772 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NCOA4Q13772 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NCOA4Q13772 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NCOA4Q13772 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NCOA4Q13772 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NCOA4Q13772 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NCOA4Q13772 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NCOA4Q13772 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NCOA4Q13772 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NCOA4Q13772 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NCOA4Q13772 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NCOA4Q13772 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NCOA4Q13772 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NCOA4Q13772 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
NCOA4Q13772 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NCOA4Q13772 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NCOA4Q13772 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NCOA4Q13772 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NCOA4Q13772 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NCOA4Q13772 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NCOA4Q13772 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NCOA4Q13772 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NCOA4Q13772 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NCOA4Q13772 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NCOA4Q13772 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NCOA4Q13772 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NCOA4Q13772 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NCOA4Q13772 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NCOA4Q13772 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NCOA4Q13772 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NCOA4Q13772 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NCOA4Q13772 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NCOA4Q13772 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NCOA4Q13772 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NCOA4Q13772 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NCOA4Q13772 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NCOA4Q13772 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
NCOA4Q13772 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NCOA4Q13772 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NCOA4Q13772 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NCOA4Q13772 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NCOA4Q13772 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NCOA4Q13772 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NCOA4Q13772 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NCOA4Q13772 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NCOA4Q13772 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 193 ms