Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTCH1Q13635 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTCH1Q13635 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTCH1Q13635 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTCH1Q13635 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTCH1Q13635 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTCH1Q13635 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTCH1Q13635 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTCH1Q13635 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTCH1Q13635 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTCH1Q13635 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTCH1Q13635 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTCH1Q13635 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTCH1Q13635 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTCH1Q13635 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTCH1Q13635 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTCH1Q13635 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTCH1Q13635 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTCH1Q13635 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTCH1Q13635 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTCH1Q13635 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTCH1Q13635 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PTCH1Q13635 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PTCH1Q13635 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PTCH1Q13635 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PTCH1Q13635 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PTCH1Q13635 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PTCH1Q13635 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PTCH1Q13635 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PTCH1Q13635 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PTCH1Q13635 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PTCH1Q13635 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PTCH1Q13635 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
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PTCH1Q13635 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PTCH1Q13635 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PTCH1Q13635 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PTCH1Q13635 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
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PTCH1Q13635 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PTCH1Q13635 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PTCH1Q13635 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTCH1Q13635 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTCH1Q13635 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
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PTCH1Q13635 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
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PTCH1Q13635 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
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PTCH1Q13635 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
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PTCH1Q13635 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTCH1Q13635 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTCH1Q13635 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTCH1Q13635 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
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PTCH1Q13635 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
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PTCH1Q13635 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTCH1Q13635 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTCH1Q13635 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTCH1Q13635 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTCH1Q13635 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTCH1Q13635 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTCH1Q13635 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTCH1Q13635 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
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