Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PDE3BQ13370 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PDE3BQ13370 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PDE3BQ13370 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
PDE3BQ13370 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PDE3BQ13370 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PDE3BQ13370 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PDE3BQ13370 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PDE3BQ13370 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PDE3BQ13370 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PDE3BQ13370 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PDE3BQ13370 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PDE3BQ13370 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PDE3BQ13370 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PDE3BQ13370 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PDE3BQ13370 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PDE3BQ13370 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PDE3BQ13370 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PDE3BQ13370 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PDE3BQ13370 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PDE3BQ13370 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PDE3BQ13370 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PDE3BQ13370 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PDE3BQ13370 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.73□□□□□ -2.29
PDE3BQ13370 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PDE3BQ13370 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PDE3BQ13370 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PDE3BQ13370 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PDE3BQ13370 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PDE3BQ13370 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PDE3BQ13370 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PDE3BQ13370 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PDE3BQ13370 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PDE3BQ13370 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PDE3BQ13370 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PDE3BQ13370 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PDE3BQ13370 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PDE3BQ13370 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
PDE3BQ13370 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PDE3BQ13370 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PDE3BQ13370 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PDE3BQ13370 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PDE3BQ13370 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PDE3BQ13370 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PDE3BQ13370 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PDE3BQ13370 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PDE3BQ13370 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PDE3BQ13370 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PDE3BQ13370 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PDE3BQ13370 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PDE3BQ13370 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PDE3BQ13370 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PDE3BQ13370 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PDE3BQ13370 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PDE3BQ13370 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PDE3BQ13370 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PDE3BQ13370 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PDE3BQ13370 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PDE3BQ13370 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PDE3BQ13370 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PDE3BQ13370 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PDE3BQ13370 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PDE3BQ13370 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PDE3BQ13370 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PDE3BQ13370 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PDE3BQ13370 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PDE3BQ13370 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PDE3BQ13370 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PDE3BQ13370 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PDE3BQ13370 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PDE3BQ13370 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PDE3BQ13370 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PDE3BQ13370 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PDE3BQ13370 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PDE3BQ13370 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PDE3BQ13370 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PDE3BQ13370 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PDE3BQ13370 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PDE3BQ13370 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PDE3BQ13370 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PDE3BQ13370 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
PDE3BQ13370 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PDE3BQ13370 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PDE3BQ13370 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PDE3BQ13370 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PDE3BQ13370 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PDE3BQ13370 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PDE3BQ13370 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PDE3BQ13370 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PDE3BQ13370 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PDE3BQ13370 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PDE3BQ13370 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PDE3BQ13370 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PDE3BQ13370 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PDE3BQ13370 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PDE3BQ13370 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PDE3BQ13370 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PDE3BQ13370 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PDE3BQ13370 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PDE3BQ13370 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
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