Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
MKRN3Q13064 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
MKRN3Q13064 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
MKRN3Q13064 RNU6ATAC14P-201ENST00000516218 91 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MKRN3Q13064 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MKRN3Q13064 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MKRN3Q13064 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MKRN3Q13064 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
MKRN3Q13064 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
MKRN3Q13064 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MKRN3Q13064 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MKRN3Q13064 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MKRN3Q13064 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MKRN3Q13064 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MKRN3Q13064 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
MKRN3Q13064 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MKRN3Q13064 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MKRN3Q13064 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MKRN3Q13064 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MKRN3Q13064 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MKRN3Q13064 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MKRN3Q13064 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MKRN3Q13064 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
MKRN3Q13064 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MKRN3Q13064 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MKRN3Q13064 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MKRN3Q13064 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MKRN3Q13064 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MKRN3Q13064 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MKRN3Q13064 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
MKRN3Q13064 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MKRN3Q13064 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MKRN3Q13064 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MKRN3Q13064 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MKRN3Q13064 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MKRN3Q13064 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MKRN3Q13064 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MKRN3Q13064 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MKRN3Q13064 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MKRN3Q13064 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MKRN3Q13064 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MKRN3Q13064 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MKRN3Q13064 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MKRN3Q13064 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MKRN3Q13064 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
MKRN3Q13064 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
MKRN3Q13064 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
MKRN3Q13064 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
MKRN3Q13064 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
MKRN3Q13064 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
MKRN3Q13064 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
MKRN3Q13064 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
MKRN3Q13064 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
MKRN3Q13064 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MKRN3Q13064 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MKRN3Q13064 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MKRN3Q13064 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
MKRN3Q13064 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
MKRN3Q13064 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
MKRN3Q13064 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
MKRN3Q13064 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MKRN3Q13064 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MKRN3Q13064 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MKRN3Q13064 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
MKRN3Q13064 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
MKRN3Q13064 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
MKRN3Q13064 U6.103-201ENST00000637085 61 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
MKRN3Q13064 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
MKRN3Q13064 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
MKRN3Q13064 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
MKRN3Q13064 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
MKRN3Q13064 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MKRN3Q13064 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MKRN3Q13064 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MKRN3Q13064 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MKRN3Q13064 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MKRN3Q13064 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MKRN3Q13064 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MKRN3Q13064 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MKRN3Q13064 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MKRN3Q13064 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MKRN3Q13064 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MKRN3Q13064 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MKRN3Q13064 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
MKRN3Q13064 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
MKRN3Q13064 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
MKRN3Q13064 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
MKRN3Q13064 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
MKRN3Q13064 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
MKRN3Q13064 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
MKRN3Q13064 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
MKRN3Q13064 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
MKRN3Q13064 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MKRN3Q13064 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MKRN3Q13064 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MKRN3Q13064 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
MKRN3Q13064 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
MKRN3Q13064 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MKRN3Q13064 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MKRN3Q13064 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
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