Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
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FOXD4Q12950 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
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FOXD4Q12950 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
FOXD4Q12950 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
FOXD4Q12950 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
FOXD4Q12950 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
FOXD4Q12950 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
FOXD4Q12950 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
FOXD4Q12950 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
FOXD4Q12950 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
FOXD4Q12950 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
FOXD4Q12950 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
FOXD4Q12950 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
FOXD4Q12950 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
FOXD4Q12950 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
FOXD4Q12950 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
FOXD4Q12950 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
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FOXD4Q12950 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
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FOXD4Q12950 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
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FOXD4Q12950 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
FOXD4Q12950 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
FOXD4Q12950 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
FOXD4Q12950 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
FOXD4Q12950 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
FOXD4Q12950 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
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FOXD4Q12950 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
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FOXD4Q12950 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
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FOXD4Q12950 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
FOXD4Q12950 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
FOXD4Q12950 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
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FOXD4Q12950 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
FOXD4Q12950 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
FOXD4Q12950 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
FOXD4Q12950 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
FOXD4Q12950 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
FOXD4Q12950 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
FOXD4Q12950 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
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FOXD4Q12950 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
FOXD4Q12950 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
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