Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ERVV-2B6SEH9 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ERVV-2B6SEH9 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ERVV-2B6SEH9 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ERVV-2B6SEH9 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ERVV-2B6SEH9 RNU6-724P-201ENST00000390958 105 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ERVV-2B6SEH9 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ERVV-2B6SEH9 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ERVV-2B6SEH9 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ERVV-2B6SEH9 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.71□□□□□ -2.3
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ERVV-2B6SEH9 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ERVV-2B6SEH9 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ERVV-2B6SEH9 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ERVV-2B6SEH9 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ERVV-2B6SEH9 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ERVV-2B6SEH9 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ERVV-2B6SEH9 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ERVV-2B6SEH9 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
ERVV-2B6SEH9 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ERVV-2B6SEH9 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ERVV-2B6SEH9 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ERVV-2B6SEH9 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ERVV-2B6SEH9 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ERVV-2B6SEH9 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ERVV-2B6SEH9 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ERVV-2B6SEH9 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ERVV-2B6SEH9 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ERVV-2B6SEH9 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ERVV-2B6SEH9 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ERVV-2B6SEH9 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ERVV-2B6SEH9 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
ERVV-2B6SEH9 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ERVV-2B6SEH9 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ERVV-2B6SEH9 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ERVV-2B6SEH9 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
ERVV-2B6SEH9 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
ERVV-2B6SEH9 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ERVV-2B6SEH9 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ERVV-2B6SEH9 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ERVV-2B6SEH9 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ERVV-2B6SEH9 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ERVV-2B6SEH9 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ERVV-2B6SEH9 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ERVV-2B6SEH9 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ERVV-2B6SEH9 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ERVV-2B6SEH9 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ERVV-2B6SEH9 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ERVV-2B6SEH9 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ERVV-2B6SEH9 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ERVV-2B6SEH9 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ERVV-2B6SEH9 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ERVV-2B6SEH9 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
ERVV-2B6SEH9 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ERVV-2B6SEH9 RNU6ATAC14P-201ENST00000516218 91 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ERVV-2B6SEH9 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
ERVV-2B6SEH9 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ERVV-2B6SEH9 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ERVV-2B6SEH9 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
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ERVV-2B6SEH9 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
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ERVV-2B6SEH9 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
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ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ERVV-2B6SEH9 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ERVV-2B6SEH9 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ERVV-2B6SEH9 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ERVV-2B6SEH9 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ERVV-2B6SEH9 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ERVV-2B6SEH9 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ERVV-2B6SEH9 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ERVV-2B6SEH9 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ERVV-2B6SEH9 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ERVV-2B6SEH9 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ERVV-2B6SEH9 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ERVV-2B6SEH9 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ERVV-2B6SEH9 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ERVV-2B6SEH9 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ERVV-2B6SEH9 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ERVV-2B6SEH9 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
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