Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Anxa10-202ENSMUST00000034054 1222 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Gm14791-201ENSMUST00000119061 1166 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Gm9440-201ENSMUST00000119667 539 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 4930440C22Rik-202ENSMUST00000190754 512 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms