Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP4

Serpinb6c, Serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade B, member 6C, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpinb6cW4VSP4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serpinb6cW4VSP4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serpinb6cW4VSP4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serpinb6cW4VSP4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serpinb6cW4VSP4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serpinb6cW4VSP4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Serpinb6cW4VSP4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpinb6cW4VSP4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms