Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Top3bQ9Z321 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms