Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Mrpl40Q9Z2Q5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Mrpl40Q9Z2Q5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Mrpl40Q9Z2Q5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Mrpl40Q9Z2Q5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Mrpl40Q9Z2Q5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Mrpl40Q9Z2Q5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Mrpl40Q9Z2Q5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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