Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms