Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms