Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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