Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ap3b1Q9Z1T1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ap3b1Q9Z1T1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms