Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lgr5Q9Z1P4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms