Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z139

Ror1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ror1Q9Z139 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ror1Q9Z139 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms