Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0V1

Kcnd3, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd3Q9Z0V1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnd3Q9Z0V1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnd3Q9Z0V1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnd3Q9Z0V1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnd3Q9Z0V1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnd3Q9Z0V1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnd3Q9Z0V1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnd3Q9Z0V1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnd3Q9Z0V1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnd3Q9Z0V1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnd3Q9Z0V1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnd3Q9Z0V1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnd3Q9Z0V1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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