Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms