Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms