Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PrkraQ9WTX2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.05■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkraQ9WTX2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms