Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTU3

Scn8a, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,978 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn8aQ9WTU3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms